Родился в семье известных в киноиндустрии людей: папа — продюсер и поэт Тахир Хуссейн (Tahir Hussain), мама — Зинат Хуссейн (Zeenat Hussain). Дядя Насир Хуссейн (Nasir Hussain) также был режиссёром. Двоюродный брат Тарик — известный актёр 70-х годов прошлого века, который снялся в таких известных фильмах, как «Yaadon Ki Baraat» и «Hum Kisise Kum Nahin».Творческая карьера Амира началась в 1973 году, когда он снялся в фильме своего дяди «Найти друг друга» (Yaadon Ki Baaraat), в роли юного Ратана. Также Аамир сыграл в нескольких фильмах под режиссурой своего кузена Мансура Кхана.
Со времени небывалого успеха фильма «Приговор» («Qayamat Se Qayamat Tak» (1988) Кхана считают одним из лучших актеров Индии. На сегодня он признан актером, сыгравшим наибольшее количество разнообразных характеров в индийском кино.
